Présentation

L’institut iGReD a développé depuis 2000 un plateau d’imagerie confocale : CLIC (Clermont Imagerie Confocale) localisé au 4ème étage du bâtiment CRBC sur le site Dunant. Ce plateau est sous la direction scientifique de Vincent Mirouse et Christophe Tatout. CLIC met à disposition 6 microscopes photoniques et 4 stations d’analyses d’images (Arivis, Imaris, Zen, Fiji, Qupath). Les quatre ingénieurs de la plateforme conseillent les utilisateurs de la préparation des échantillons à l’analyse des images.



Nos offres de service

La plateforme est accessible après une réunion préalable obligatoire. L’accès se fera selon différentes modalités : autonomie après une formation individuelle obligatoire, accompagnement partiel ou complet, collaboration ou prestation.

Les offres de services sont les suivantes :
  • Formation à l’utilisation microscopes
  • Accompagnement partiel ou complet pour la réalisation d’acquisition sur les microscopes
  • Formation à l’utilisation des logiciels d’analyse d’images
  • Développement d’outils pour l’analyse d’images

Equipements

Microscopes disponibles

  • Microscopes confocal à balayage laser :
    Leica SP8 + Lightning + Navigator 
    Zeiss LSM 800 + Airyscan
    Zeiss LSM 980 + Airyscan2 + module spectral
  • Microscope confocal à disque rotatif : Zeiss Cell Observer Spinning Disk
  • Microscope à lumière structurée : Leica DM6000 MMAF
  • Microscope à feuillet de lumière : Zeiss Lightsheet LS7

Stations d’Analyse

  • Poste 1 : Imaris 9.8.2, Imaris XT & Vantage
  • Poste 2 : Imaris 9.8.2 & ImarisXT
  • Poste 3 : Zen, Qupath
  • Poste 4 : Arivis, Fiji, Zen

Témoignages

Groupe LIMAGRAIN
Marie JAVELLE
Centre de recherche “Traits and technologies Limagrain Field Seeds”

Afin de confirmer la localisation subcellulaire de protéine d’intérêt dans des cellules végétales, des travaux d’imagerie en microscopie confocale ont été réalisés sur des tissus foliaires et des cellules végétales isolées. L’emploi de différentes séquences d’adressage fusionnées à une protéine fluorescente ont permis de vérifier ces localisations subcellulaires et de sélectionner les meilleures séquences d’adressage permettant d’atteindre le compartiment ciblé avec spécificité.