Présentation

Nous avons une forte expertise en génomique, métagénomique, métatranscriptomique, microbiologie environnementale et bioinformatique. Nous avons développé plusieurs logiciels de détermination de sondes permettant d’accéder à la diversité génétique de familles de gènes (Militon et al., 2007; Terrat et al., 2010; Dugat-Bony et al., 2011; Parisot et al., 2012). Nous avons également développé une approche innovante de capture de gènes par hybridation dans un cadre de génomique environnementale (Gasc et al., 2018, 2017, 2016; Ranchou-Peyruse et al. 2017; Bragalini at al., 2014; Denonfoux et al., 2013). L’approche peut être utilisée sur tous types d’organismes (bactéries, archées, eucaryotes qu’ils soient isolés ou en mélanges).

Nos offres de service

  • Détermination de sondes de capture,
  • Capture de gènes par hybridation,
  • Traitements bioinformatiques des données de séquençage.

Moyens technologiques

  • Capture de gènes par hybridation,
  • Préparation de grands framents d’ADN,
  • Traitements bioinformatiques des données de séquençage.

Exemples de réalisations

  • Diversité microbienne non accessibles par approches actuelles,
  • Capture de grands fragments d’ADN,
  • Capture d’ADNc,
  • Capture de gènes fonctionnels.