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Traductions
Plate-Forme d’Exploration du Métabolisme (PFEM)
Présentation
La Plate-Forme d’Exploration du Métabolisme (PFEM) est une plateforme technologique et scientifique qui accompagne des projets de métabolomique et protéomique. Cette structure commune INRA-UCA, labellisée IBiSA et certifiée ISO 9001 et NF X50-900, est membre de l’infrastructure nationale (PIA) MetaboHUB (MTH ; www.metabohub.fr) qui a pour but de développer des outils, des méthodologies et d’accompagner de grands projets impliquant des approches de métabolomique et de fluxomique.
Nos offres de service
Analyses à haut débit de fluides biologiques (urines, plasmas, extraits de microorganismes…) par LC-MS/RMN. Préparations standardisées et automatisées des échantillons.
- Détermination de profils métaboliques par LC-MS/RMN.
- Traitement des données et analyses statistiques.
- Identification de biomarqueurs par LC-MSMS et RMN 2D.
- Analyse LC-RMN
Moyens technologiques / installations / équipements
Exemples de réalisations
La composante UCA de la PFEM est adossée à l’Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF) et partenaire au sein du service UCA-PARTNER (http://start.univ-bpclermont.fr/rubrique26.html). Son cœur d’expertise se positionne principalement en lien avec les thématiques de l’équipe BIOMETA (métabolisme microbien des nuages et des sols). Plus largement, la PFEM-UCA s’intéresse à l’impact de facteurs environnementaux (effets climatiques, pesticides et médicaments, etc.) sur le métabolisme cellulaire, principalement microbien (souches pures et consortia). Nos collaborations locales s’appuient sur l’ensemble des laboratoires de la Fédération de Recherches en Environnement (FRE CNRS3467 / INRA).
Exemples de projets en cours :
Exemples de projets en cours :
- Etude des stress atmosphériques : thermique (biocloud ; ICCF, Clermont-Ferrand), oxydatif (peroxomic ; ICCF, Clermont-Ferrand), toxique/mercure (ANR inhale ; ICCF, Lyon-Grenoble), temporel (Manip10ans ; ICCF, Clermont-Ferrand).
- Adaptations métaboliques de l’abeille : nosémose (metabolobees ; LMGE, Clermont-Ferrand), effet combiné de stresseurs (ANR beeloss ; LMGE, Clermont-Ferrand).
- Physiologie de l’arbre : nutrition azotée et débourrement (PopSapNitrOmic ; PIAF, Clermont-Ferrand).
- Impact des ruminants sur l’effet de serre : (RedNex ; UMRH, Clermont-Ferrand), (Rumen stability ; UMRH, Clermont-Ferrand), (Methane In Vitro ; UMRH, Clermont-Ferrand), (Monascus ; UMRH, Clermont-Ferrand).
- Physiologie de l’hibernation : (Ours ; Strasbourg).
- Métabolisme extracellulaire : Rémanence de voies enzymatiques dans le sol (Exceed ; LMGE-UREP, Clermont-Ferrand).
Contacts
Responsable service
Marie Lagrée
Tél.: 04 73 40 55 10
Tél.: 04 73 40 55 10
Référent scientifique
Cyril Jousse
Tél.: 04 73 40 72 51
Tél.: 04 73 40 72 51
Référent scientifique
Anne-Marie Delort
Tél.: 04 73 40 77 14
Tél.: 04 73 40 77 14
Analyste RMN liquide
Mounir Traïkia
Tél.: 04 73 40 75 82
Tél.: 04 73 40 75 82
Analyste statistique et réseaux métaboliques
Binta Diémé
Tél.: 04 73 40 72 51
Tél.: 04 73 40 72 51
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